Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ccdc18Q640L5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ccdc18Q640L5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc18Q640L5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc18Q640L5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms