Protein–RNA interactions for Protein: Q62421

Sh3gl3, Endophilin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl3Q62421 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl3Q62421 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3gl3Q62421 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3gl3Q62421 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms