Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nfe2l1Q61985 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2l1Q61985 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2l1Q61985 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms