Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbpQ61805 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbpQ61805 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbpQ61805 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LbpQ61805 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbpQ61805 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbpQ61805 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms