Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama3Q61789 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lama3Q61789 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama3Q61789 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms