Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msi1Q61474 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms