Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcnhQ61458 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnhQ61458 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnhQ61458 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnhQ61458 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms