Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BcanQ61361 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BcanQ61361 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BcanQ61361 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BcanQ61361 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BcanQ61361 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BcanQ61361 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BcanQ61361 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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