Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nab1Q61122 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nab1Q61122 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nab1Q61122 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms