Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lamb3Q61087 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms