Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sim2Q61079 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sim2Q61079 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sim2Q61079 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sim2Q61079 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sim2Q61079 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sim2Q61079 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Sim2Q61079 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sim2Q61079 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sim2Q61079 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Sim2Q61079 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sim2Q61079 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sim2Q61079 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sim2Q61079 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sim2Q61079 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sim2Q61079 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sim2Q61079 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sim2Q61079 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sim2Q61079 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sim2Q61079 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sim2Q61079 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sim2Q61079 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sim2Q61079 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sim2Q61079 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sim2Q61079 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sim2Q61079 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sim2Q61079 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sim2Q61079 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sim2Q61079 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sim2Q61079 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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