Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Klf3Q60980 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf3Q60980 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf3Q60980 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms