Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Meis1Q60954 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Meis1Q60954 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Meis1Q60954 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Meis1Q60954 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms