Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppp1r1bQ60829 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r1bQ60829 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r1bQ60829 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppp1r1bQ60829 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppp1r1bQ60829 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppp1r1bQ60829 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms