Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sik1Q60670 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sik1Q60670 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sik1Q60670 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms