Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mks1Q5SW45 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms