Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ggnbp2Q5SV77 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ggnbp2Q5SV77 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ggnbp2Q5SV77 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms