Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d4Q5RJF7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d4Q5RJF7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d4Q5RJF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms