Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Nlrc3Q5DU56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrc3Q5DU56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Nlrc3Q5DU56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nlrc3Q5DU56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nlrc3Q5DU56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrc3Q5DU56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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