Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam208bQ5DTT3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms