Protein–RNA interactions for Protein: Q504P9

Rhox4e, Reproductive homeobox 4E, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4eQ504P9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox4eQ504P9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox4eQ504P9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox4eQ504P9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms