Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q4VA45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q4VA45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q4VA45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q4VA45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q4VA45 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q4VA45 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q4VA45 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q4VA45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q4VA45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q4VA45 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q4VA45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q4VA45 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Q4VA45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q4VA45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q4VA45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q4VA45 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q4VA45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q4VA45 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q4VA45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q4VA45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q4VA45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q4VA45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q4VA45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q4VA45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q4VA45 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q4VA45 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Q4VA45 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q4VA45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q4VA45 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q4VA45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q4VA45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q4VA45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q4VA45 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q4VA45 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q4VA45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q4VA45 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q4VA45 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Q4VA45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q4VA45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q4VA45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q4VA45 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q4VA45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q4VA45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q4VA45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q4VA45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q4VA45 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q4VA45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q4VA45 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q4VA45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q4VA45 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q4VA45 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q4VA45 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q4VA45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q4VA45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q4VA45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q4VA45 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q4VA45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q4VA45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q4VA45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q4VA45 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Q4VA45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q4VA45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q4VA45 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q4VA45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q4VA45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q4VA45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q4VA45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q4VA45 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q4VA45 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q4VA45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q4VA45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q4VA45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms