Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhox3aQ4TU90 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox3aQ4TU90 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms