Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10488Q4KL05 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10488Q4KL05 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10488Q4KL05 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms