Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne3Q4FZC9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne3Q4FZC9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syne3Q4FZC9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms