Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5935Q497S0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5935Q497S0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms