Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1nQ497L1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2al1nQ497L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms