Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933427I04RikQ3V053 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4933427I04RikQ3V053 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms