Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prom2Q3UUY6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prom2Q3UUY6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prom2Q3UUY6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prom2Q3UUY6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prom2Q3UUY6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prom2Q3UUY6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prom2Q3UUY6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms