Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29609Q3UU56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm29609Q3UU56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm29609Q3UU56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms