Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm10Q3UTQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm10Q3UTQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Prdm10Q3UTQ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms