Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem253Q3UNB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem253Q3UNB8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Tmem253Q3UNB8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem253Q3UNB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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