Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdgfl2Q3UMU9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms