Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf3bQ3ULL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf3bQ3ULL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf3bQ3ULL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf3bQ3ULL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf3bQ3ULL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf3bQ3ULL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf3bQ3ULL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf3bQ3ULL6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms