Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UJP5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UJP5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UJP5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UJP5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UJP5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q3UJP5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UJP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q3UJP5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UJP5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJP5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1515.9 ms