Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph3aQ3UFY4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3aQ3UFY4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms