Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nom1Q3UFM5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nom1Q3UFM5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nom1Q3UFM5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nom1Q3UFM5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms