Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem109Q3UBX0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem109Q3UBX0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem109Q3UBX0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms