Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenplQ3U3S3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenplQ3U3S3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenplQ3U3S3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms