Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbxip1Q3TVI8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pbxip1Q3TVI8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pbxip1Q3TVI8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbxip1Q3TVI8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms