Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pnpla6Q3TRM4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pnpla6Q3TRM4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms