Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca4Q3TKT4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Smarca4Q3TKT4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Smarca4Q3TKT4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Smarca4Q3TKT4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC38.76■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms