Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccbe1Q3MI99 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccbe1Q3MI99 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms