Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Jsrp1Q3MI48 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Jsrp1Q3MI48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jsrp1Q3MI48 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms