Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp1aQ2LKU9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp1aQ2LKU9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms