Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd11Q1RNF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd11Q1RNF8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd11Q1RNF8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms