Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Gli2Q0VGT2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gli2Q0VGT2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gli2Q0VGT2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms