Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms