Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssrp1Q08943 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssrp1Q08943 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms