Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn3Q07409 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cntn3Q07409 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms